Processus d'accumulation du carbone organique dissous en surface de la Méditerranée Nord Occidentale: dynamique et rôle des bactéries hétérotrophes
| Type | : | AP |
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| Nature | : | Production scientifique |
| Au bénéfice du Laboratoire | : | Oui |
| Statut de publication | : | Publié |
| Année de publication | : | 2008 |
| Type de thèse | : | Thèse de doctorat |
| Date | : | - |
| Nombre de pages | : | - |
| Directeur de thèse | : | Rassoulzadegan, Fereidoun |
| Université | : | Université Pierre et Marie Curie |
| Département académique | : | |
| Auteur | : | TRABELSI Asma |
| DOI | : | - |
| URL | : | - |
| Abstract | : | Les processus d’accumulation du carbone organique dissous (COD), ont été étudiés dans les eaux côtières de la Méditerranée Nord-Occidentale et ont été liés à la variation de l’activité et la structure de la communauté bactérienne. Nous avons suivi les changements de la concentration du COD en fonction de l’abondance microbienne et l’activité bactérienne, durant 16 mois d’étude (Avril 2005-Juillet 2006) et à partir d’un échantillonnage hebdomadaire dans la baie de Villefranche. Nos résultats ont montré des concentrations périodiques élevées de COD et une accumulation de COD dans le milieu naturel durant la période de stratification estivale. Les concentrations de COD été corrélées positivement avec l’abondance des bactéries et négativement avec les abondances des ciliés et des virus. Parallèlement, notre étude à montré que la lyse virale été négativement corrélée avec l’abondance bactérienne et l’efficacité de croissance, ce qui conduit à une faible assimilation du carbone durant les périodes de pics viraux. On a également testé, durant trois périodes, les changements saisonniers de l’activité bactérienne et les variations des concentrations du COD dans la colonne d’eau de surface (5, 20, 50m). Les valeurs les plus élevées de COD ont été observées durant la période de stratification et ont été reliés aux faibles valeurs de BGE (8.52\%). En comparaison, les valeurs les plus élevées de BGE (22.38\%) ont été mesurées durant la période de « bloom » de phytoplancton. La faible efficacité de croissance était la conséquence d’un taux de respiration élevé et une production bactérienne faible mesurée durant la même période.Afin de compléter notre connaissance sur les processus d’accumulation du COD, on a testé l’hypothèse du mauvais fonctionnement de la boucle microbienne dans une approche expérimentale examinant le rôle des additions de phosphates sur les réponses bactériennes dans différentes expérimentations saisonnières. L’expérience réalisée en Juillet a montré que les additions de phosphates augmentent la consommation de COD jusqu'à 10 fois, en passant de 0.036µmol C l-1h-1 dans les témoins à 0.356µmol C l-1h-1 dans les traitements P2 (1 µmol P l-1). En plus des précédents paramètres, nous avons testé les relations saisonnières de la concentration de COD et la diversité de l’assemblage bactérien en étudiant le gène 16S RNA par gel électrophorèse à gradient dénaturant (DGGE) basé sur la PCR. On a démontré que l’intensité relative des phylotypes spécifiques appartenant à SAR11, Roseobacter et Bacteroidetes, étaient corrélés avec les concentrations du COD. L’addition de phosphates augmente les intensités relatives de ces phylotypes impliqués dans la consommation du COD. Ainsi la limitation en phosphates était responsable de l’accumulation du COD observée durant la période de stratification. |
| Mots-clés | : | Abondance microbienne, Accumulation de COD, Activité bactérienne, DGGE, Diversité, Limitation en phosphates, Méditerranée nord-occidentale |
| Commentaire | : | - |
| Tags | : | B&B |
| Fichier attaché | : | - |
| Citation | : |
Trabelsi A (2008) Processus d'accumulation du carbone organique dissous en surface de la Méditerranée Nord Occidentale: dynamique et rôle des bactéries hétérotrophes. Université Pierre et Marie Curie
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