Recherche de composés bioactifs et étude de l’effet du statut azoté sur le métabolome de Tetraselmis suecica en biofilm

Type : AP
Nature : Production scientifique
Au bénéfice du Laboratoire : Oui
Statut de publication : Publié
Année de publication : 2024
Type de thèse : Thèse de Doctorat
Date : 05/12/2024
Nombre de pages : 260
Directeur de thèse : Antoine Sciandra
Université : Sorbonne Université
Département académique : Ecologie Marine
Auteur : LOPEZ Julien
DOI : -
URL : https://hal.science/tel-04754294
Abstract : ABSTRACT
Biofilms comprise a microbial community growing in a matrix of self-produced extracellular polymeric substances (EPS), adhered to a submerged support. Compared with their bacterial homologue, microalgal biofilms are still little studied. The proximity of the microorganisms in these biofilms, composed of at least one species of microalgae and its phycosphere, suggests that the effect of the allelopathic compounds produced is exacerbated. The greater resistance to biological contamination and resilience of microalgal biofilms compared to planktonic cultures suggests the presence of compounds of interest with antibacterial properties, enabling, for example, the control of the associated bacterial community. The aim of this work is to identify bioactivities derived from biofilms of the haptophyte Tetraselmis suecica and to characterize the effects of nitrogen status (level of nitrogen limitation) on these bioactivities. Following a literature review on the influence of nitrogen on the production of phycotoxins and allelopathic compounds, antibacterial and anticancer bioassays were carried out on several aquaculture pathogenic bacterial strains and cancer cell strains. A metabolomic study of T. suecica biofilms grown with nitrate was also carried out to understand metabolome responses to nitrogen limitation.

RESUME
Les biofilms comprennent une communauté microbienne qui se développe dans une matrice de substances polymériques extracellulaires (ou EPS) autoproduite, adhérée à un support immergé. En comparaison avec leur homologue bactérien, les biofilms de microalgues sont encore peu étudiés. La proximité des microorganismes dans ces biofilms, composés au minimum d'une espèce de microalgue et de sa phycosphère, suggère que l’effet des composés allélopathiques produits est exacerbé. La plus grande résistance à la contamination biologique et résilience des biofilms de microalgues par rapport aux cultures planctoniques laisse supposer la présence de composés d'intérêt aux propriétés antibactériennes permettant, par exemple, de contrôler la communauté bactérienne associée. L'objectif de ces travaux est d'identifier des bioactivités issues de biofilms de l'haptophyte Tetraselmis suecica et de caractériser les effets du statut azoté (niveau de limitation par l’azote) sur ces bioactivités. Après une revue bibliographique portant sur l'influence de l'azote sur la production des phycotoxines et de composés allélopathiques, des essais biologiques antibactériens et anticancéreux ont été réalisés sur plusieurs souches bactériennes pathogènes d’aquaculture et souches cellulaires cancéreuses. Une étude métabolomique des biofilms de T. suecica cultivée avec du nitrate a également été réalisée pour comprendre les réponses du métabolome à une limitation par l’azote.
Mots-clés : phototrophic biofilm, microalgae, nitrogen, semiochemical, marine chemical discovery, metabolomic Biofilm phototrophe, microalgue, azote, sémiochimie, découverte de produits chimiques marins, métabolomique
Commentaire : Financement : ED129
Jury :
Pr. Rodolphe Lemée (Sorbonne Université, France) Président
Pr. Cédric Hubas (MNHN, France) Rapporteur
Dr. Soizic Morin (INRAE, France) Rapportrice
Dr. Joséphine Leflaive (Université de Toulouse, France) Examinatrice
Dr. Annick Ortalo-Magné (Université de Toulon, France) Examinatrice
Dr. Olivier Bernard (INRIA, France) Invité
Dr. Eva Ternon (Sorbonne Université, France) Invitée
Dr. Antoine Sciandra (LOV, UMR 7093 CNRS, France) Directeur de thèse
Tags : CHOC PHYTOPULSE
Fichier attaché : -
Citation :
Lopez J (2024) Recherche de composés bioactifs et étude de l’effet du statut azoté sur le métabolome de Tetraselmis suecica en biofilm. Sorbonne Université Ecologie Marine, 260