Construction et validation des modèles en biologie : vers une nouvelle génération d'expériences
| Type | : | AP |
|---|---|---|
| Nature | : | Production scientifique |
| Au bénéfice du Laboratoire | : | Oui |
| Statut de publication | : | Publié |
| Année de publication | : | 2004 |
| Type de thèse | : | - |
| Date | : | 22/01/2004 |
| Nombre de pages | : | - |
| Directeur de thèse | : | |
| Université | : | Université de Nice |
| Département académique | : | |
| Auteur | : | BERNARD Olivier |
| DOI | : | - |
| URL | : | - |
| Abstract | : | Au cours de mon exposé je présenterai l'ensemble de mes travaux qui se situent entre l'automatique et la biologie. Les systèmes biologiques sont complexes, non linéaires, leur fonctionnement est souvent mal connu et il n'est généralement possible de ne mesurer qu'un faible nombre de leurs variables. Ces points d'achoppement amoindrissent l'efficacité des algorithmes de l'automatique classique, trop sensibles aux incertitudes caractéristiques de la biologie. La première étape a donc consisté à développer des méthodes pour élaborer par étapes successives le modèle d'un biosystème et finalement à le valider en en évaluant les différents niveaux d'incertitude. Simultanément, pour garantir un contenu plus informatif des données, il fallait définir un cadre expérimental simplifié, où les forçages (entrées) appliquées au système vivant seraient mieux maîtrisées et où son évolution serait mieux suivie. Cela m'a conduit à travailler sur un système de culture de phytoplancton piloté par ordinateurs, au Laboratoire d'Océanographie de Villefranche-sur-Mer, puis plus tard à m'intéresser aux bioréacteurs. Je montrerai enfin comment des algorithmes de contrôle et d'observation non linéaires qui tiennent compte des niveaux d'incertitude du modèle permettent d'imaginer de nouvelles expériences de laboratoire. Mes propos seront étayés par des exemples issus de domaines très différents : écologie (croissance du phytoplancton, développement de populations de copépodes, compétition bactérienne, etc.), épuration biologique de l'eau (digestion anaérobie, lagunage, etc.), agro-alimentaire (production de vanilline), etc. |
| Mots-clés | : | - |
| Commentaire | : | Jury : - Georges Bastin (Professeur, UCL, Louvain-la-Neuve, Belgique) - Pierre Bernhard (Professeur, I3S, Sophia) - Philippe Gros (DR IFREMER, Nantes) - Jan Van Impe (Professeur, KUL, Leuven, Belgique) - Jean-Marie Legay (Professeur, LBBE ,Lyon) - Claude Lobry (Professeur, INRA, Montpellier) - Michel Loreau (Professeur,ENS, Paris) |
| Tags | : | HDR |
| Fichier attaché | : | - |
| Citation | : |
Bernard O (2004) Construction et validation des modèles en biologie : vers une nouvelle génération d'expériences. Université de Nice
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